果蝇属于小型蝇类，体长1.5-4毫米间。虫体以黄褐色者居多，也有些是黑色的。头部有一对大而多呈鲜红色的复眼，两复眼内侧有三对眼缘刚毛，复眼间的后头中央微微隆起，形成一个单眼三角区，三个单眼的前下方生有一对单眼刚毛。后头中间（单眼三角区后上方），有一对后头顶刚毛，两***向而生。在其两侧还有一对内头顶刚毛和一对外头顶刚毛。触角第三节呈椭圆形或圆形，触角芒羽状分枝，着生于两复限间的前下方。有些雄性的果蝇其前足的跗节上常有成排的鬃毛，叫性梳。头部具许多刚毛，触角3节呈椭圆形或圆形，触角芒羽状，有时呈梳齿状，复眼鲜红色。翅Sc很短，R1亦短，前缘脉的边缘常有缺刻。幼虫体11节，每节具微小钩状刺1环。