秦元勋教授曾如此总结黄河大学的特点：体制新，中外合办，实行董事会领导下的校长负责制；管理方法新，教职工全部实行聘任制，学生实行学分制；学制新，每年设三个学期，把暑假变为一个学期，利用中外学者暑期之暇，把他们请来讲学；专业设置新，重点开设国内短缺、国外新发展起来的学科；发展道路新，先从研究生院办起，努力培养一批高级人才，送到国外深造，几年后就会形成一支可观的高质量教师队伍，再逐步发展本科；教师来源新，可以广揽海内外英才任教。黄河大学成立伊始便建立一项制度，每周六下午是学术报告时间，正式开课后的第一个周六下午，秦元勋校长率先做名为《试论‘一要吃饭，二要建设’的数学模式》的学术报告。黄河大学还不设党委，这在当时的中国可谓特例中的特例，就是在今天看来，也不可思议。教师大部分是由全美国各大学的教授组成，在最先启动的美国研究、英美文学、经济管理和计算机软件四个研究生专业里，教材由各位教授指定。以美国研究为例，老师团队来看纽约州立大学、佛罗里达州立大学、南伊利诺大学和坦普尔大学，课程包括美国通史、美国外交史、中美关系、微观经济学、宏观经济学、国际贸易、美国***、美国人文地理、政治学、社会学等。教材基本上是美国大学正在使用的课本，全用英文授课。