蛋白质的分子结构是指蛋白质分子中各种化学键和分子间力的排列和组合方式。

蛋白质分子通常由一条或多条肽链组成，这些肽链之间通过氢键、盐键、二硫键等化学键相互连接，形成三维结构。这种三维结构决定了蛋白质的生物学功能，如酶的催化活性、抗原-抗体相互作用等。

此外，蛋白质分子中还含有各种氨基酸残基，这些残基之间的相互作用也是蛋白质分子结构的重要组成部分。蛋白质分子的结构可以通过X射线晶体学、核磁共振、质谱等技术进行测定，以帮助科学家更好地了解蛋白质的结构和功能。

蛋白质的分子结构由氨基酸组成，氨基酸是蛋白质的基本结构单元。每个氨基酸都有一个氨基(-NH2)和一个羧基(-COOH)，以及一个侧链(R)。氨基酸通过脱水缩合反应形成肽键，将氨基和羧基连接起来，形成多肽链。多肽链经过折叠、旋转等空间构象形成三级结构，即蛋白质的最终形态。蛋白质的分子结构决定了其生物学性质和功能，如酶催化、信号传递、结构支撑等。

一级结构：组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。

二级结构：依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构，主要为α螺旋和β折叠。

三级结构：通过多个二级结构元素在三维空间的排列所形成的一个蛋白质分子的三维结构。

四级结构：用于描述由不同多肽链（亚基）间相互作用形成具有功能的蛋白质复合物分子。