苍蝇最怕青蛙、蜻蜓、蜘蛛、螳螂、蚂蚁、蜥蜴、壁虎、食虫虻和鸟类等捕食性天敌。此外苍蝇最怕甲虫、螨和黄蜂等寄生性天敌，它们会将卵产在蝇蛆或蛹体内，孵出幼虫后取食蝇蛆和蝇蛹。干燥畜禽粪有利于苍蝇天敌的生长。