水利建设专项收入是指企业从水利建设项目中获得的收入，包括施工、设计、咨询、监理等各个环节的收入。企业在申报企业所得税时，需要对水利建设专项收入进行申报。
首先，企业需要将水利建设专项收入与其他收入进行分开申报。在企业所得税申报表中，将水利建设专项收入单独列出，并填写相应的金额。如果企业在水利建设项目中有多个环节的收入，需要将各个环节的收入分别列出，并注明相应的税率和扣除项目。
其次，企业需要注意水利建设专项收入的税率和扣除项目。根据国家税务总局的规定，水利建设专项收入的税率为10%，扣除项目包括成本、费用和捐赠等。企业需要按照规定正确计算税额，并在申报表中注明。

最后，企业需要保留相关的证明文件。企业在申报水利建设专项收入时，需要提交相应的证明文件，如水利建设项目合同、*****、付款凭证等。企业需要妥善保管这些证明文件，以备税务机关的核查。
总之，企业在申报水利建设专项收入时，需要注意分开申报、正确计算税额和保留相关证明文件等问题。只有做到规范申报，才能避免税务风险，确保企业的合法权益。