1、板块不同：沪市只有主板与B股；深市有主板/中小板/创业板和B股。主板指以大型/成熟/稳定的企业为主要上市对象的市场板块，B股是指以外币计价/面向境内外用户发行和交易的普通股票，中小板是指以中小型/成长性较强的企业为主要上市对象的市场板块，创业板是指以高新技术/高成长性的创新型企业为主要上市对象的市场板块；

2、股票代码不同：沪市主板是60开头，B股是900开头；深市主板是000开头，中小板是002开头/创业板是300开头/B股是200开头；

3、B股标价不同：沪市B股是以美元竞价；深市B股是以港币竞价；

4、交易制度不同：基本的交易规则是一致的，差别在于收市最后3分钟（14：57——15：00），具体在于沪市的交易规则是连续竞价；深市的交易规则是***竞价。连续竞价是指在交易时间内，买卖双方根据实时行情随时提交委托并成交的方式，***竞价是指在一定时间内，买卖双方提交委托但不成交，等到***竞价结束时按照一定规则统一撮合成交的方式。