糖尿病住院医保报销比例是根据医院和医疗花费不同，分段计算的。如果是去镇卫生院就医，报销比例是60%；二级医院是40%；三级医院是30%。如果住院医疗费用一次性或全年累计应报医疗费高于5000元的就要分段进行报销，如果医疗花费在5001-10000元可支付的比例65%，如果医疗花费在10001-18000元可赔付的比例是按照70%进行补偿的。