农村医疗保险属于社会医疗保险的一种，而社保中也有职工医疗保险，二者都是医疗保险，隶属不同的统筹基金，因此农村医疗保险和社保是冲突的，不能并存，但可以相互转换。

如果二者冲突，参保人不知道如何选择，建议以社保为先，注销掉农村医疗保险。相比之下，尽管社保中医疗保险的缴费比农村医疗保险要多，但其保障力度更强，能报销的医疗费用更多。