新生儿医保报销比例如下所示：

普通门诊费用按年为结算单位。对于门诊看病费用在300元以下的部分，医保基金支付比例为40%，即最高报销120元/年。这部分费用一次性结算完成。而对于300元以上的部分费用，需要个人自付。

大病门诊费用，例如血友病、再生障碍性贫血、系统性红斑狼疮等病种，医保基金没有起付限，支付比例为75%。

住院费用根据医疗机构等级设定不同的起付标准和基金支付比例。以三级医院为例，如果住院费用标准超过500元，医保基金支付比例为80%。