工资5000扣除五险一金后，大概剩下3890元。计算方法为:5000-5000×8%×2%×0.2%×12%=3890元。其中，养老保险单位缴纳20%,个人缴纳8%;医疗保险单位缴纳10%,个人缴纳2%;失业保险单位缴纳1.5%,个人缴纳0.2%;工伤保险和生育保险完全由单位缴纳。住房公积金单位和个人比例都是12%,全部进入个人账户。
五险一金的缴费比例和基数都是按照职工工资总额来计算的。此外，五险一金的缴纳是个人所得税的扣除标准之一。