城镇医疗和农村合作医疗的区别为：

1.参保人不同，城镇医疗（即职工医保）是由职工参保，保费由用人单位和职工共同缴纳，而农村合作医疗（即新农合）主要由农民朋友们参保，是一种互助共济的医疗制度，也属于国家医保；

2.城镇医疗所需要缴纳的保费相对于农村合作医疗来说要高一些；

3.城镇医疗所能报销的费用相对于农村合作医疗来说要高一些；

4.农村合作医疗的起付线相对于城镇医疗来说要低一些。