花呗显示还款失败，但是卡里的钱却被扣了的话，客户可以去联系支付宝客服问清楚情况，看看究竟是怎么一回事，确保自己卡里的钱成功偿还了花呗，之后资金还是否会退回。

如果钱已经成功还进去，只是系统还没来得及更新信息的话，那无需担心。如果的确操作失败，等之后退回款项，客户再重新操作还款就是了。要是因为系统问题导致逾期，客户还可以去进行申诉，免得个人信用受影响。