1、地理位置不同：中山大学珠海校区位于广东省珠海市，而中山大学本部位于广东省广州市。

2、创办时间不同：中山大学珠海校区创办于2000年，而中山大学本部创办于1924年。

3、院系及专业设置不同：中山大学珠海校区有旅游学院、国际金融学院、国际翻译学院等实体院系，而中山大学本部则拥有更为全面的学科体系和更多的专业选择。