花都市位于广东省中南部，珠江三角洲北缘，广州市北面。

地处东经112°57′07″~113°28′10′，北纬23°14′57″~23°37′18″，北回归线横贯中部。花都东部和东北部与从化区交界，西部与三水市相连，西南部和南海市接壤，南部紧靠广州市白云区，北部与清远市毗连。

2000年，全市总面积960.38平方千米，约占全国总面积的万分之一。