克隆将减少遗传变异，通过克隆产生的个体具有同样的遗传基因，同样的疾病敏感性，一种疾病就可以毁灭整个由克隆产生的群体。克隆技术的使用将使人们倾向于大量繁殖现有种群中最有利用价值的个体，而不是按自然规律促进整个种群的优胜劣汰从这个意义上说，克隆技术干扰了自然进化过程。克隆技术是一种昂贵的技术，需要大量的金钱和生物专业人士的参与，失败率非常高。转基因动物提高了疾病传染的风险。克隆技术应用于人体将导致对后代遗传性状的人工控制，克隆技术引起争论的核心就是能否允许对发育初期的人类胚胎进行遗传操作。这是很多伦理学家所不能接受的。克隆技术也可用来创造超人，或拥有健壮的体格却智力低下的人。克隆技术对家庭关系带来的影响也将是巨大的，一个由父亲的DNA克隆生成的孩子可以看作父亲的双胞胎兄弟，只不过延迟了几十年出生而已。