树木地面以上的主茎部分，是树木的主体，占树木体积的50~90%。它一方面将树根吸收的养分由边材运送到树叶，另一方面把叶子制造的养料沿韧皮部输送到树木的各个部分，并与树根共同支撑整个树木。树干是树的重要组成部分，具有木质特性，多应用于家具制造、建筑材料等。树干分为五层。第一层是树皮。树皮是树干的表层，可以保护树身，并防止病害入侵。第二层是韧皮部。这一层纤维质组织把糖分从树叶运送下来。第三层是形成层。这一层十分薄，是树干的生长部分，所有其他细胞都是自此层而来。第四层是边材。这一层把水分从根部输送到树身各处，此层通常较心材浅色。第五层是心材。心材是老了的边材，二者合称为木质部。树干绝大部分都是心材。