四六级证书丢了是可以补办的。

第一种方法是学校教务处会记录你的准考号和成绩。所以你可以找教务处打印四六级成绩并盖章。在国网网申的时候，扫描上传这张成绩单，并在备注里说明一下情况即可。

第二个方法较费时间但可信度较高。英语四六级证书是由全国大学英语四六级考试委员会颁发的。该委员会在2005年公布的四六级证书的补办政策言明，2005年6月后参加考试的学生，考试后两年内，凡因成绩单遗失的，可申请补发成绩证明。需要补发成绩证明的学生须凭学籍所在院校教务处出具的证明(含参加考试时间、考试级别、准考证号、成绩并加盖公章)和身份证复印件，向考委会提出申请。经核实后委员会将补发统一印制的“CET考试成绩证明”，不再补发证书。但审核后确定不能补发成绩证明的，将回函说明。每年集中补办两次，具体时间为：第一次，3月15日至6月15日；第二次，9月15日至12月15日。是不是感觉流程好多，但是这也是最为稳妥的办法。