氨基酸态氮的含量代表存在于土壤蛋白质和多肽类化合物中，降解后可释放出各种氨基酸的土壤氮素。它是土壤氮素中已知的数量最多的一类化合物，土壤中已鉴定出30多种氨基酸，其中占优势的通常是存在于微生物细胞壁中的氨基酸，如谷氨酸、甘氨酸、丙氨酸、赖氨酸以及天门冬氨酸等。

土壤中氨基酸态氮主要存在方式：

1、游离氨基酸，含量甚微，主要存在于土壤溶液及土壤微孔隙中；

2、以氨基酸、肽或蛋白质类-黏土矿物结合态存在，结合在黏粒表面或晶格中；

3、以氨基酸、肽或蛋白质类-有机胶体结合态存在，以氢键、肽键或共价键结合；

4、由微生物细胞衍生而来的含粘肽物质；

5、与糖类结合的粘肽物质（如微生物细胞壁）；

6、以磷壁（酸）质存在，即多元醇的直链多聚体或含酯键联结丙氨酸的磷酸甘油形态。