兰博基尼第六元素和FE版的区别主要有以下几点：

1. 定价不同：FE版比第六元素更贵。

2. 车辆数量不同：FE版只有99辆，而第六元素则更为普及，生产数量不限。

3. 外观设计不同：虽然两个版本都以兰博基尼为灵感，但它们的外观设计不同。FE版的外观更为简洁，而第六元素则更为夸张和运动。

4. 车辆性能不同：FE版和第六元素的性能也有所不同。FE版的性能更为出色，包括更高的加速性能和更高的最高速度。

5. 附加功能不同：FE版还附带了一些额外功能，比如专门为电竞比赛设计的模式，以及更多的车辆自定义选项。