迷你金刚，一种神奇的小型机器人。他们具有一种奇妙的能力，当变形金刚与迷你金刚合体后，可以极大地提升战斗力。

汽车人和霸天虎两方为此展开争夺，战争愈演愈烈，而变形金刚最大的威胁——宇宙大帝，也正向塞博特恩逼近。舰队描述的是平行宇宙所发生的战争，除了有两派之外，还有一个神秘迷你金刚派别，对战争起着重要的作用。

故事发生在2010年，三个孩子无意中打开变形金刚星球中的能源枢纽，释放出一种名为迷你战士的新式变形金刚，他释放出强大的力量，掌控汽车人与霸天虎之间的力量均衡……