港澳通行证都是一样的，不分商务和普通。当事人可以办理港澳通行证时，申请办理商务签注。
《中华人民共和国往来港澳通行证、签注审批签发管理工作规范》：
（二）申请条件：
2、商务。（1）受单位派遣赴香港或者澳门商务。“单位”是指：经国家工商管理部门登记注册，具有独立法人资格的企业及其分支机构，或者在国家税务部门办理了税务登记且有生产经营的单位以及境外企业常驻内地代表机构。申请3个月或者1年多次商务签注，所在单位须事先向所在地公安机关出入境管理部门登记备案。各地根据本地区实际情况制定登记备案的具体办法和审批条件，并对外公布。（2）个体工商户经营者赴香港或者澳门商务。（3）驾驶往返内地与香港或者澳门专用交通工具人员。
（四）与申请事由相应的证明材料：
2、商务。（1）受单位派遣赴香港或者澳门商务，已办理登记备案的单位人员，须提交登记备案证明和派遣函；未办理登记备案的单位人员，须交验经年检的工商营业执照副本或者有关登记证书和税务登记证书、社会保险凭证原件，并提交复印件和派遣函。（2）个体工商户经营者申请赴香港或者澳门商务，须交验经年检的工商营业执照副本和税务登记证书原件，并提交复印件。