在现有的技术中分辨龟的公母，多数以外形为主，或者以内窥镜、腹腔镜直接观察它的生殖系统。

在家庭饲养的环境下，龟幼龄的时候很难分辨公母，到了亚成年或者到了成年以后，公母在体型上的变化就会慢慢显现。首先，雄性的尾根会比较粗，尾巴比较长，并且泄殖孔多数在背甲以外。雌性尾巴相对短小，泄殖孔多数在背甲以内。

雄性的巴西龟有一个很明显的特征，是在成年之后，它的指甲会非常的长，这也是雄性的一个最基本的特征。雄性的体型和雌性也会差得非常多，雄性一般偏小，成年之后多数在250-500g不等，雌性多数能够长到1000g，有的大一点甚至长到2000g。