集装箱种类主要有5种，集装箱按所装货物种类分有干货集装箱（DRY CONTAINER）、散货集装箱（BULK CONTAINER）、液体货集装箱、冷藏箱集装箱，以及一些特种专用集装箱，如汽车集装箱、牧畜集装箱、兽皮集装箱等等。
杂货集装箱是最普通的集装箱，主要用于运输一般杂货，适合各种不需要调节温度的货物使用的集装箱，一般称通用集装箱。
散货集装箱是用以装载粉末、颗粒状货物等各种散装的货物的集装箱。
液体货集装箱是用以装载液体货物的集装箱。
冷藏集装箱是一种附有冷冻机设备，并在内壁敷设热传导率较低的材料，用以装载冷冻、保温、保鲜货物的集装箱。
汽车集装箱是一种专门设计用来装运汽车，并可分为两层装货的集装箱。
牲畜集装箱（PEN CONTAINER）是一种专门设计用来装运活牲畜的集装箱，有通风设施，带有喂料和除粪装置。
兽皮集装箱是一种专门设计用来装运生皮等带汁渗漏性质的货物，有双层底，可存贮渗漏出来的液体的集装箱。