花甲不能吃的地方有：

1、甲壳：甲壳就是包裹在花甲外面的壳，花甲壳一般比较坚硬，并且没有什么食用价值，因此不能食用。

2、肠腺：由于花甲长期生活在海里或者河中，食物种类繁杂，含有大量的细菌及其它重金属物质，食用之后不利于人体健康，因此花甲的肠腺不建议食用。可以将花甲烫开壳，然后用牙签将花甲的肠腺挑出来，再将花甲清洗干净即可。