中国工程院院士和中国科学院院士主要在研究方向，设立目的等方面是不同的，具体为：

1、研究方向不同。中国工程院院士主要以工程研究为主；而中国科学院院士主要以科技研究为主。

2、荣誉称号的目的不同。中国科学院院士是中华人民共和国设立的科学技术方面的最高学术称号；而中国工程院院士是中国工程科学技术方面的最高学术称号。

3、设立标准不同。中国工程院院士的标准为具有很高的工程科学技术水平和在国际上享有良好声誉，对中国工程科学技术事业发展作出贡献或在促进中国工程科学技术界国际交往方面有重要作用的人；而中国科学院院士为在科学技术领域做出系统的、创造性的成就和重大贡献，热爱祖国，学风正派的人。

注意：中国工程院院士，是中国工程科学技术方面的最高学术称号，为终身荣誉，于1994年6月设立。

中国工程院院士由选举产生，对年满80周岁的院士授予资深院士称号。具有很高的工程科学技术水平和在国际上享有良好声誉，对中国工程科学技术事业发展作出贡献或在促进中国工程科学技术界国际交往方面有重要作用的外国籍专家、学者，可被提名并当选为中国工程院外籍院士。

据2019年3月中国工程院官网显示，中国工程院院士共有892人，包括资深院士439人；另有外籍院士91人。已故院士252人、已故外籍院士19人。