胚胎干细胞不是全能干细胞。实际上，只有受精卵和早期卵裂球细胞具有发育为完整个体的能力，是全能干细胞。当胚胎发育到囊胚时，其干细胞具有分化为各种细胞类型的能力，是多能干细胞。

全能干细胞是能够分化发育成为各种组织器官的细胞，其全能性很强。全能干细胞是指受精卵到卵裂期32细胞前的所有细胞。全能干细胞是指具有无限分化潜能，能分化成所有组织和器官的干细胞。具有形成完整个体分化潜能。胚胎干细胞就属于这一种。胚胎干细胞在进一步的分化中，可形成各种组织干细胞，又称多能干细胞，多能干细胞也叫APSC多能细胞，它具有分化出多种细胞组织的潜能，但失去了发育成完整个体的能力，发育潜能受到一定的限制。

多能干细胞，具有分化出多种细胞组织的潜能，但失去了发育成完整个体的能力，发育潜能受到一定的限制。骨髓多能造血干细胞是典型的例子，它可分化出至少十二种血细胞，但不能分化出造血系统以外的其它细胞。

多能干细胞（Pluripotent Stem Cells）是一类具有自我更新、自我复制能力的多潜能细胞。在一定条件下，它可以分化成多种APSC多能细胞，多能干细胞(HSC)具有分化出多种细胞组织的潜能，但失去了发育成完整个体的能力，发育潜能受到一定的限制。