氦气有毒性，但被认为是一种比较安全的气体，因为其与人体之间距离很大，所以对人体造成的危害还没有完全认识。此外，氦气的有毒性在大气压下表现出来比在其它情况下更小。
首先，这种气体尽管是无色无味的，但它可以用溴气来代替，20度C和101.3KPa下，2升溴气可替换20升氦气，这两种气体都有毒性。
其次，氦气窒息毒性很大，但受到存在水汽的大气的稀释，因而使其窒息毒性大大降低，它的急性毒性也比其它同样气体要小。
最后，如果一个人闭门不出，在一定时间内吸入了大量氦气，那么可能就会造成脑血管损伤。此外，由于氦气有一定的腐蚀性，所以有高浓度的氦气，也可能对皮肤和呼吸系统造成损害或***。