国立清华大学和清华大学的区别主要如下：

1、学校英文名称缩写不同：国立清华大学英文名称缩写为NTHU，而清华大学英文名称缩写为THU。

2、学校位置不同：国立清华大学位于中国台湾省新竹市，清华大学位于中国北京市。

3、主管部门不同：国立清华大学主管部门为中国台湾地区教育主管部门，清华大学主管部门为教育部。

4、学院设置不同：国立清华大学设有理学院、工学院、生命科学院、电机资讯学院、人文社会学院等；清华大学设有建筑学院、环境学院、人文学院、美术学院、药学院等。

材料补充：

国立清华大学和清华大学专业设置分别介绍如下：

1、国立清华大学开设的专业主要包括：化学工程、材料科学工程、电机工程、动力机械工程、光电物理原子科学、物理学、中国文学、微电子、化学、计量财务金融、电机资讯、资讯工程、电子工程、通讯工程、光电工程、工业工程、纳米工程与微系统、生命科学、医学科学、先进光源科技等。

2、清华大学开设的专业主要包括：建筑学、城乡规划、风景园林、建筑环境与能源应用工程、土木工程、工程管理、交通工程、水利水电工程、水利科学与工程、电气工程及其自动化、经济学、社会学、国际政治等。