微信零钱通不会损失本金。零钱通的实质是货币基金理财，货币基金类的理财产品收益率是会波动的，从风险等级来看，货币基金的风险等级都是“低风险”，安全性比较高。货币基金是风险最低的一类基金，能够赚取稳健收益，基金的收益波动很小，适合保守型风险测评等级用户。货币基金历史上没有亏损过。

零钱通的实质是货币基金理财，货币基金类的理财产品收益率是会波动的，基金公司不保证最低投资收益，也不保证本金一定不会亏损，所以将资金转入到零钱通中，从理论上来讲，是存在亏损本金的可能性的。不过由于货币基金一般都是投资于银行存款、央行票据、商业票据、国债等有价证券，因此零钱通本金发生亏损的可能性是非常小的。用户在使用微信支付时，要注意保管好账户信息，以免发生账户被盗的情况。

通常情况下，微信零钱通是不会损失本金的。微信零钱通属于货币基金，风险极低，并且这类货币基金一般不会造成本金损失。也就是说，微信零钱通的安全系数还是比较高的，偶尔会出现系统升级或者节假日收益延迟到账的情况，一般情况下是不会出现亏损的。