吴中区历史悠久，人文荟萃，是古吴文化的发源地。

约一万年前的旧石器时代，吴地已有先民生息繁衍。五千年前的新石器时代，创造了先进的“良渚文化”。三千多年前泰伯在吴地建“勾吴”国，始有历史纪录。公元前221年，秦始皇统一中国，设置“吴县”，县名沿用至20世纪；1995年6月，经国务院批准，撤消吴县，建立吴县市（县级）；2000年12月31日，撤消吴县市，原吴县市辖区分设为吴中区与相城区；2001年2月28日正式宣布。在这块有着深厚历史文化积淀的土地上，历来人文荟萃、英才辈出。兵圣孙武、草圣张旭、塑圣杨惠之、绣圣沈寿、北宋著名政治家范仲淹、主持营造北京故宫的明代建筑大师蒯祥等一大批历史名人曾生活在吴中大地，谱写了吴中历史千古流芳的华美篇章。 1949年4月27日，吴县解放，市、县分设，析城区和郊区置苏州市，周围乡村为吴县，东山、西山及太湖湖区划建太湖行政办事处。1953年5月，苏南人民行政公署太湖办事处改建震泽县。1959年撤销震泽县，复并入吴县，隶属苏州专员公署（1960年1月7日，国务院批准撤销震泽县，并入吴县）。 解放后的吴县，没有另建县城，全县的党政机关驻于苏州市区。为了适应改革开放的需要，1984年开始，吴县在离苏州市中心约3千米的城南开辟总面积为20平方千米的新城区。1989年8月，吴县机关迁入新城区。 1995年6月8日，国务院批准，撤销吴县，设立吴县市，以原吴县行政区域为吴县市区域，市人民***驻长桥镇。