细胞质的结构包括基质，细胞器和内含物。

细胞质有物质运输功能，包括对营养物质的吸收、原材料的摄取和代谢废物的排出及产物的分泌。

细胞质是进行新陈代谢的主要场所，同时它对细胞核也有调控作用。绝大多数的化学反应都在细胞质中进行，糖酵解、核酸、脂肪酸和氨基酸代谢的各种阶段，需要依靠细胞质中处于相对游离状态的酶来完成。为细胞内各种生化反应提供场所，保证正常的生命活动。