毛坦厂中学的学费因学生成绩和年级而有所不同。一般来说，理科一本线及以上的考生，靠前学期收费在2500~6800元之间（包含300元住宿费用），第二学期收费在6500元左右；文科一本线131分及以下，理科一本线156分及以下的考生，靠前学期男女生均收费3.8万元，第二学期收费统一为男生6500元，女生6800元。