微生物对人类既有帮助，也有危害，例如：

（1）酵母菌可以帮助发酵糖液。

（2）蘑菇，本身就是一种大型的食用真菌，属于微生物，如香菇、大红菇等。

（3）部分微生物病毒可导致人类疾病，如天花病毒。

（4）部分动物性微生物可寄生在人体内，造成流行性传染病，如由阿米巴痢疾原虫导致的阿米巴痢疾。