常见的魔方有六种颜色，橙色对应红色，黄色对应白色，蓝色对应绿色。

其实魔方并不只有一种配色方案，现今所流行的是并非最初的版本，最初的魔方配色方案是现今的日本方案，而现今的配色方案是将一对相似色系的颜色安排在相对两边，而日本则维持原来的配色，事实上也还有其他多个版本的配色方案。 第一种是由香港生产的最初的配色，最早在80年代就有销售，现今大多数销售的和它不同的是将茶色换成了橙色。 第二种也是香港生产的，是和第一种同一系列的魔方，但是配色稍有不同。 第三种是由美国生产的，配色完全改动，由白对黄，蓝对绿，红对橙（现今最常见的配色方案）。 第四种是由匈牙利原产的，配色接近于美国产的魔方。 第五种是由日本生产的，与现今“标准配色”仅蓝白色互换。这原本是rubik教授最初研发出魔术方块时的配色，而在传到日本流行后，rubik公司 听取色彩研究者的意见，将一对相似色系的颜色安排在相对两边，而日本则维持原来的配色。