一是指女生的隐私部位。

大部分人都不好意思直说，所以都会用小妹妹来代指女生的隐私部位。二是年龄大的人对比自己小的女孩子的一种称呼 ，在南方用的比较多，北方一般不这样称呼。三是一个称呼而已。男生叫女生小妹妹，那么就说明男生觉得女生比较可爱。四是是对卡哇伊女生的一种 调侃称呼。五是对情人或J女的称呼。