厦深铁路沿途要经过20个站点，从北到南依次为厦门北站、前场站、角美火车站、漳州站、洋奎站、漳浦站、云霄站、诏安站、饶平站、潮汕站、潮阳站、普宁站、葵潭站、陆丰站、汕尾站、鲘门站、惠东站、惠州南站、深圳坪山站、深圳北站。

厦深铁路是中国中长期铁路网规划中”四纵四横“快速客运通道的”一纵“，是沿海铁路的重要组成部分。北起厦门，经漳州、潮州、汕头、揭阳、汕尾、惠州引入深圳。