截至2018年9月，深圳地铁3号线和深圳地铁5号线在深圳东站东广场侧设布吉站，其中A、B出口和西广场通道连接深圳东站。

截至2018年9月，深圳东站西侧的公交站有布吉街站、布吉线站和深圳东站西广场站，东侧的公交站有深圳东站和深圳东站东广场站，公交线路总计59条。

客运流量

截至2013年1月21日，深圳东站开通运营1个月，日均发送旅客3000多人次。

2014年铁路暑运，深圳东站累计发送旅客60万人次。

2015年2月4日，深圳东站全天累计发送旅客1.3万人次。

2016年铁路春运，深圳东站累计发送旅客63万人次。

2017年铁路春运，深圳东站累计发送旅客64万人次。

2018年铁路春运，深圳东站累计发送旅客130多万人次。