河南农业大学许昌校区和本部的区别主要在校区位置和招生专业上。河南农业大学许昌校区位于许昌市建安区，而本部则在郑州市。此外，许昌校区录取分数线一般比本部低一些，学费也相对较低。

在招生专业方面，许昌校区主要承担的是河南农业大学的部分办学任务，负责部分涉农专业和专升本学生的教学工作。而本部则主要负责本科生的教学工作，同时也会承担部分研究生的教学工作。