肽键和肽链的区别是形成不同。肽键是一分子氨基酸的α-羧基和一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的酰胺键，即-CO-NH-。肽链是由多个氨基酸相互连接形成的含有多个肽键通过氨基酸脱水缩合形成的一条链状结构。
氨基酸通过肽键连接形成的产物称为肽。最简单的肽是由二个氨基酸残基形成的肽，称为二肽。由于肽中的氨基酸已经不是游离的氨基酸了，所以称为氨基酸残基。一条多肽链的一端含有一个游离的氨基，另一端含有一个游离的羧基。