一、享受范围不一样：社保中医疗保险不能享受住院生育医疗报销，严重慢性病门诊(大病)职工享受17个病种，居民享受8个病种。

二、报销比例不一样：一是住院报销比例不一样。职工医疗保险在职职工住院报销比例为甲类92%，乙类70-80%;退休职工住院报销比例为甲类92%，乙类70-80%；居民医疗保险住院报销比例为一级医院甲乙类分别为80%、70%，二级医院甲乙类分别为70%、60%，三级医院甲乙类分别为60%、50%。二是严重慢性病门诊(大病)报销比例不一样：职工医保报销比例75%，城镇居民医保50%。

保障人群：城乡居民医疗保险的保障对象是没有工作的居民，和没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人；新农合的保障对象主要就是农村农民；

保障力度：城乡居民医疗保险的起付线，比新农合高，在大医院的报销比例也比新农合高；而新农合在乡镇卫生院的报销费用就比较高；城乡居民医疗报销的缴费是每个月都要交，最高可以报销70%，新农合是一年交一次，最高报销30%。

一是覆盖的人群不同。城镇居民医保主要覆盖城镇户籍的居民，新农合主要覆盖农村户籍居民。

二是管理的部门不同。城镇居民医保主要由人社部门管理，新农合多数地方由卫生部门管理。

三是保障待遇的侧重点不同。城镇居民医保主要保住院和门诊大病兼顾普通门诊，所以住院及门诊大病待遇都要高于新农合。新农合的门诊待遇水平要高于城镇居民医保。