年终奖有减5000免税，这种说法是不准确的。在中国个人所得税法中，个人所得税是按照税前收入总额计算的，而不是按照税后收入总额计算的。因此，即使你的年终奖有减5000，也不能直接减少个人所得税的计算基数。
然而，在个人所得税法中，有一些特定的扣除项目可以减少个人所得税的计算基数，例如子女教育、住房贷款利息、赡养老人等。这些扣除项目是按照固定金额或者一定比例计算的，可以在个人所得税申报时进行扣除。

在2019年，个人所得税法进行了重大改革，实行了新的个税起征点和税率结构。根据新的个税法，个人所得税起征点为5000元，即个人总收入达到5000元才需要缴纳个人所得税。对于年终奖，如果你的全年收入没有超过5000元，那么你是不需要缴纳个人所得税的。但是，如果你的全年收入超过5000元，那么你的年终奖也需要按照个人所得税法规定的税率进行缴纳个人所得税。
总之，年终奖有减5000免税这种说法是不准确的。个人所得税是按照税前收入总额计算的，而不是按照税后收入总额计算的。如果你想减少个人所得税的计算基数，可以通过申报特定的扣除项目来实现。在缴纳个人所得税时，需要按照个人所得税法规定的税率进行计算缴纳。