在中国，产品质量法是保障消费者权益的重要法律，对于生产、销售不合格产品的企业，将会受到处罚和罚款。根据《中华人民共和国税收征收管理法》规定，扣除违法所得的税收是合法的，但是否扣除税收还需要具体情况而定。
如果企业生产、销售不合格产品，导致消费者受到伤害或损失，根据《产品质量法》的规定，相关企业需要承担赔偿责任。在进行赔偿时，企业需要扣除违法所得，这是合法的。因为企业生产、销售不合格产品所获得的收益是不合法的，扣除违法所得可以降低企业的违法成本，同时也可以保护消费者的权益。
但是，如果企业生产、销售的产品质量存在问题，但并未导致消费者受到损失，那么扣除违法所得的税收就需要具体情况而定。如果企业及时采取了补救措施，消费者并未受到损失，那么扣除违法所得的税收可能会受到挑战。因此，需要根据具体情况来判断是否需要扣除违法所得的税收。
总之，对于生产、销售不合格产品的企业，无论是否导致消费者受到损失，都应该承担相应的法律责任，并且需要扣除违法所得。这不仅可以保护消费者的权益，也可以促进企业的合法经营。