期末结转损益类科目是会计年度结束后将各项收入、费用和利润等结转到资本或利润分配账户的过程。在这个过程中，公允价值变动损益余额是需要进行转移的。
公允价值变动损益是指由于资产或负债的公允价值发生变化而产生的损益，这种损益在会计核算中是以公允价值变动损益科目进行记账的。在年末结转损益的过程中，这个科目的余额是需要进行结转的。
如果公允价值变动损益科目的余额在借方，那么在结转损益的过程中，需要将其转移到贷方，以体现这部分损益的实现。同样地，如果公允价值变动损益科目的余额在贷方，那么在结转损益的过程中，需要将其转移到借方。

需要注意的是，公允价值变动损益的结转是根据实际情况进行的。如果在年末结转时，公允价值变动损益还没有实现，那么就不需要进行结转。只有在公允价值变动损益实现后，才需要进行结转。
综上所述，期末结转损益类科目中，公允价值变动损益余额在借方是需要进行转移的，以体现其实现的损益。但是需要根据实际情况进行结转。