国债逆回购手续费由成交时利率和计息天数决定，国债逆回购分为1-182天期，比如1天期手续费为0.001%，那么10万元每笔手续费为1元，再比如7天期手续费为0.005%，那么10万元每笔手续费为5元。

国债一、二、三、四天回购佣金水平为10万元一天一元；七天回购，10万元每笔5元；十四天回购，10万元每笔10元；二十八天回购，10万元每笔20元，二十八天以上回购，10万元每笔30元封顶。

国债逆回购经常操作的品种有1天、2天、3天、4天、7天。通常是1天10万手取1元手续费。