深圳市食品经营许可证是指符合国家和深圳市食品安全标准的食品生产、加工、流通、餐饮服务等单位和个人，按照法定程序获得的许可证书。在深圳市，申请食品经营许可证可以通过网上申请流程，具体流程如下：

1.登录深圳市食品药品监督管理局网站（http://www.szfd.gov.cn/），进入“网上服务”栏目，点击“食品经营许可证”选项。

2.在“食品经营许可证”页面中，选择“企业申请”或“个体工商户申请”选项，根据实际情况选择需要办理的许可证类型。

3.填写申请表格，包括申请人基本信息、经营场所信息、经营范围等内容，上传相关资料，如证件照片、经营场所照片、食品安全管理制度等。

4.提交申请后，等待审核。深圳市食品药品监督管理局将对申请材料进行审核，并在5个工作日内进行答复。

5.审核通过后，缴纳相关费用并领取许可证。缴费方式可以选择网上支付或到指定银行缴费，领取许可证可以到深圳市食品药品监督管理局指定的窗口领取。

需要注意的是，在申请食品经营许可证时，需要提供真实、准确的资料。如果发现提供虚假资料，将会被取消许可证，并按照相关法律法规进行处罚。同时，申请人还需要遵守深圳市的食品安全管理制度，确保经营的食品安全、卫生。