海南公司注代理记账的费用因不同代理记账公司而异，一般来说，费用会根据以下因素进行计算：

公司规模：公司规模越大，需要处理的账目越多，费用也就相应增加。

业务复杂度：如果公司业务复杂度较高，例如涉及到多个行业、多个地区的业务，需要处理的账目也就更加繁琐，费用也会相应增加。

服务内容：不同的代理记账公司提供的服务内容也不同，如果需要更全面的服务，费用也会相应增加。

服务周期：代理记账的服务周期一般为一年，不同的服务周期也会影响费用的高低。

根据以上因素，海南公司注代理记账的费用一般在2000元到1万元之间。不过，具体费用还需要根据公司的实际情况进行具体计算。

此外，需要注意的是，选择代理记账公司时，不仅要考虑费用因素，还要考虑公司的信誉度、服务质量等因素。只有选择一家专业、可靠的代理记账公司，才能确保公司财务管理的顺利运作。