深圳公司名称变更的办理流程如下：

准备材料：公司名称变更申请书、公司章程、股东决议、营业执照副本、法人身份证复印件等。

提交申请：将准备好的材料提交到深圳市工商局企业登记窗口。

审核材料：工商局会对提交的材料进行审核，如发现问题会要求补充材料。

发布公告：审核通过后，工商局会在《深圳特区报》上公告公司名称变更事项，等待3个工作日。

领取新营业执照：公告期满后，持原营业执照和公告剪报到工商局领取新营业执照。

可以在网上进行公司名称变更吗？

深圳市工商局已经实现了企业名称变更网上办理，企业可以登录深圳市工商局网上服务大厅进行操作。具体流程如下：

登录深圳市工商局网上服务大厅。

选择“企业名称变更”服务事项。

填写申请表格并上传相关材料。

缴纳相关费用。

工商局审核材料并发布公告。

领取新营业执照。

需要注意的是，网上办理需要企业具备数字证书，且材料需要符合规定的格式和标准，否则会影响审核进度。如果企业不具备数字证书，也可以委托代理公司或律师事务所进行办理。